More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3887 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  71.38 
 
 		 269 aa  387  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  72.12 
 
 		 269 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  72.12 
 
 		 269 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  71.38 
 
 		 269 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  68.77 
 
 		 269 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  65.8 
 
 		 269 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  53.96 
 
 		 295 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  52.47 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  52.57 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  50.58 
 
 		 275 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  47.64 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  48.64 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  43.94 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  45.08 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  46.79 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  43.61 
 
 		 307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  43.23 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  30.46 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  30.06 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.06 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  27.06 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2185  septum site-determining protein MinD  28.87 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000542736  unclonable  0.00000174808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.51 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  26.71 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.35 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.35 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.35 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01605  septum site-determining protein MinD  29.84 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  35.61 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.61 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1626  ParA family protein  35.61 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00224937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1047  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4276  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0699  ParA family protein  35.61 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.61 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2973  ParA family protein  35.61 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2314  ParA family protein  35.61 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0184356  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1041  ParA family protein  35.61 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1996  cell division inhibitor MinD  29.23 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  31.82 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  27.52 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2359  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723291  normal  0.455428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2174  septum site-determining protein MinD  28.87 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000643693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2251  septum site-determining protein MinD  28.87 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000178028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  27.02 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1202  ParA family protein  35.61 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1628  septum site-determining protein MinD  28.35 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000684278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  30.11 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2383  septum site-determining protein MinD  28.35 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000153952  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  29.21 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.48 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  29.3 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  25.2 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0926  septum site-determining protein MinD  28.27 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0213983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.79 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1165  septum site-determining protein MinD  29.02 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000537171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.25 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.33 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2577  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  28.83 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2336  septum site-determining protein MinD  27.18 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0379601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  26.7 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  27.93 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2113  septum site-determining protein MinD  26.8 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000128974  normal  0.232041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  29.58 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2425  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184306  normal  0.063488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1901  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000001062  normal  0.370789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1867  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000037885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1894  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000304586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.19 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.3 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  25.3 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2353  septum site-determining protein MinD  27.84 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.013257  normal  0.155337 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  25.3 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.97 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  31.41 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  24.81 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.19 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.32 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.19 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>