More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3148 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  100 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  47.1 
 
 
295 aa  259  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  48.68 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  44.78 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  46.74 
 
 
269 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  47.13 
 
 
269 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  45.8 
 
 
269 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  47.15 
 
 
274 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  45.8 
 
 
269 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  46.79 
 
 
260 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  45.8 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  47.78 
 
 
267 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  45.35 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  45.42 
 
 
293 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  44.32 
 
 
307 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  43.94 
 
 
307 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  43.61 
 
 
307 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  41.29 
 
 
306 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.82 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.76 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  26.67 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  33.12 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.38 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
231 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 
231 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.86 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  30 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 
215 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.37 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  26.45 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.45 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.75 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4540  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4346  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4182  septum site-determining protein; cell division inhibitor  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4193  septum site-determining protein; cell division inhibitor  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4582  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4567  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4680  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132031  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.31 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0667  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132527  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4528  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.87 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4294  septum site-determining protein MinD  32.89 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2774  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  27.98 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.58 
 
 
211 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  26.58 
 
 
252 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.38 
 
 
257 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 
255 aa  52  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  27.85 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.39 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3163  septum site-determining protein MinD  32.21 
 
 
265 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.16 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  34.11 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3344  septum site-determining protein MinD  30.81 
 
 
271 aa  51.6  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0809847  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  33.06 
 
 
265 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3784  septum site-determining protein MinD  32.43 
 
 
266 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0077808  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  30 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.5 
 
 
215 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.07 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  28.47 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  40.62 
 
 
201 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.5 
 
 
462 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  25.49 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  25.49 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  33.77 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.22 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  25.49 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  26.26 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  29.86 
 
 
233 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  26.14 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  29.8 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1820  septum site-determining protein MinD  30.87 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  33.08 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  24.7 
 
 
264 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 
256 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.67 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  27.01 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.44 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.89 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.92 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.61 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.44 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 
255 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  27.67 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.39 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  24.84 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>