More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4781 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  631  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  80.92 
 
 		 307 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  77.45 
 
 		 307 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  75.66 
 
 		 307 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  51.09 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  49.06 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  47.73 
 
 		 269 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  47.73 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  47.01 
 
 		 269 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  46.21 
 
 		 269 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  45.08 
 
 		 267 aa  232  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  46.59 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  42.86 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  43.12 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  43.94 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  43.77 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  40.52 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  41.44 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  24.64 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.17 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  30.22 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.39 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.41 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.01 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.01 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.61 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  23.79 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.3 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.58 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.13 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  26.57 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  23.3 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.63 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  22.97 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  22.97 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.02 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  22.82 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  28.78 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  29.85 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.3 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  23.36 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  25.5 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  27.84 
 
 		 405 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  23.51 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  32.03 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.43 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  24.35 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.31 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  24.84 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  28.78 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  29.5 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  30.28 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  21.51 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  21.51 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.66 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  23 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.15 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  28.87 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  24.22 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.39 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  24.57 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  29.29 
 
 		 484 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  24.66 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  30.89 
 
 		 503 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.53 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  28.64 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  28.77 
 
 		 397 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 		 229 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3692  hypothetical protein  28.79 
 
 		 468 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.576535  normal  0.38395 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  27.22 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  26.75 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.9 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 		 217 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.21 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  26.75 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  22.76 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.71 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  22.05 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  22.05 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  22.05 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  22.05 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  22.05 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  22.05 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  26.11 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  22.05 
 
 		 253 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>