More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3062 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  100 
 
 		 307 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  87.58 
 
 		 307 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  82.41 
 
 		 307 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  80.92 
 
 		 306 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  52.88 
 
 		 284 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  48.3 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  47.35 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  47.73 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  44.73 
 
 		 275 aa  235  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  44.74 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  45.83 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  45.08 
 
 		 269 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  45.28 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  43.94 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  43.61 
 
 		 260 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  41.54 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  44.32 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  42.96 
 
 		 274 aa  195  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.85 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.97 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  25.47 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  28.66 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  31.65 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  27.81 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.45 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.79 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  25.98 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  25.98 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.65 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  25.47 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.5 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  26.19 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  27.5 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.32 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.14 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  28.22 
 
 		 201 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  24.84 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.32 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.32 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.12 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.74 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  26.32 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.75 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.58 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24.67 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.57 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  26.76 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  26.75 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  26.11 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.71 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.59 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.58 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.56 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  27.56 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  27.84 
 
 		 405 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.29 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  26.95 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  25.59 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.88 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  26.22 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  26.54 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.66 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  23.6 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  34.11 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  28.26 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  24.71 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  26.22 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  30.77 
 
 		 408 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.29 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  27.67 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  27.92 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  25.24 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3773  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 469 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  25.48 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.2 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.99 
 
 		 407 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.88 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.16 
 
 		 437 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 352 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>