More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2389 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  87.58 
 
 		 307 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  83.66 
 
 		 307 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  77.45 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  51.64 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  46.79 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  47.35 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  47.35 
 
 		 269 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  44.32 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  45.83 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  44.32 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  42.42 
 
 		 269 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  43.77 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  43.94 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  43.23 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  43.61 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  40.37 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  42.07 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.93 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  30.94 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  33.33 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  23.18 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.68 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.07 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  25.77 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  26.71 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.81 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 		 264 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  27 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.94 
 
 		 211 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  24.22 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  28.36 
 
 		 252 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.73 
 
 		 261 aa  52.8  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 		 217 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.8 
 
 		 214 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.43 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.43 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  27.78 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  24.43 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 		 229 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  25.71 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.28 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  31.36 
 
 		 408 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  26.75 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  27.39 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  25.71 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  24.52 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.11 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.4 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.87 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 		 212 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.66 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 		 265 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  24.22 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  26.06 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  26.39 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.68 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.47 
 
 		 215 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  26 
 
 		 268 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  25 
 
 		 256 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  24.38 
 
 		 263 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.56 
 
 		 217 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.5 
 
 		 238 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.82 
 
 		 217 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.82 
 
 		 217 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1524  cell division ATPase MinD  25.35 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.016628  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.38 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  23.6 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.95 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.95 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  27.39 
 
 		 273 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0395  cell division ATPase MinD  25.35 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0440  septum site-determining protein MinD  25.35 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.22 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.05 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>