More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1042 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  99.63 
 
 		 269 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  95.54 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  71 
 
 		 269 aa  407  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  71.75 
 
 		 269 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  69.52 
 
 		 269 aa  391  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  72.12 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  54.89 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  55.89 
 
 		 284 aa  288  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  50 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  50.19 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  47.73 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  47.35 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  47.35 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  48.28 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  46.74 
 
 		 293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  46.79 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  46.36 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  27.47 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  29.73 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  29.73 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  32.24 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  28.99 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  28.12 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  26.22 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  30.57 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.57 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  28.93 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.22 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  29.85 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  28.31 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  28.82 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  29.15 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  27.49 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  27.78 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.05 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  31.58 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  27.65 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  27.65 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.05 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  29.76 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  29.76 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  30.07 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  28.22 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  29.76 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  27.63 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  30.36 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.54 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.82 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  27.13 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  28.05 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.83 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  27.13 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  27.17 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  26.06 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  28 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.81 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.48 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.81 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.81 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  25.49 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  26.67 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.48 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.54 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.37 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  29.52 
 
 		 397 aa  55.8  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.11 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.33 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  29.19 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.06 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.26 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  28.1 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.09 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.71 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.76 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>