More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0187 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 269 aa  543  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  95.54 
 
 		 269 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  95.17 
 
 		 269 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  69.89 
 
 		 269 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  70.63 
 
 		 269 aa  388  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  68.77 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  71.75 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  53.11 
 
 		 295 aa  288  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  55.51 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  49.81 
 
 		 275 aa  244  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  48.86 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  46.59 
 
 		 306 aa  238  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  47.51 
 
 		 267 aa  234  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  45.83 
 
 		 307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  47.92 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  45.83 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  45.98 
 
 		 293 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  45.98 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  28.45 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  31.06 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  30.04 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  31.06 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  30 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  31.06 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  31.48 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.12 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  29.45 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  29.45 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  29.45 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.06 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  30.43 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.52 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  29.38 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  30.43 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.81 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  26.69 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  27.33 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  28.99 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  28.83 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  27.54 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.18 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.61 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.61 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  29.85 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.34 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.61 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.61 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  28.18 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.18 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  27.33 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  29.07 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  28.4 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.22 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  25.28 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  28 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  27.88 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  30.81 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.72 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  27.61 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  26.71 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.72 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0346  septum site-determining protein MinD  28.87 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  28.57 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  27.93 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  27.93 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.38 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  25.44 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.82 
 
 		 405 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.07 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  23.29 
 
 		 397 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 		 348 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  29.07 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  23.63 
 
 		 397 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  27.54 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.86 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  29.22 
 
 		 266 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>