More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3318 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3318  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 
274 aa  556  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  64.45 
 
 
293 aa  340  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2789  ATPase MipZ  60.32 
 
 
267 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0738  chromosome partitioning ATPase protein-like  47.55 
 
 
269 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  47.55 
 
 
269 aa  232  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2795  ATPase MipZ  44.89 
 
 
284 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116074  normal  0.419153 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3887  chromosome partitioning protein  48.64 
 
 
260 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0820632  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0187  chromosome partitioning ATPase  47.92 
 
 
269 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1719  chromosome partitioning protein  46.24 
 
 
295 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161268  normal  0.162144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2703  chromosome partitioning protein  46.42 
 
 
269 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1042  hypothetical protein  46.42 
 
 
269 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3148  ATPase MipZ  47.15 
 
 
278 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2618  putative chromosome partitioning protein  44.53 
 
 
269 aa  221  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4781  hypothetical protein  44.04 
 
 
306 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  43.68 
 
 
275 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3563  ATPase MipZ  44.74 
 
 
307 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2389  chromosome partitioning protein ParA  42.32 
 
 
307 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.4126  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3062  putative chromosome partitioning protein ParA  43.23 
 
 
307 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.669279  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.21 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.21 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
210 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.08 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  25.31 
 
 
207 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  34.07 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  28.11 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.67 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  26.24 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  24.53 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.53 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.5 
 
 
284 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  25.35 
 
 
258 aa  59.3  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.77 
 
 
209 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  33.55 
 
 
217 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  27.48 
 
 
233 aa  58.9  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.98 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  26.52 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  32.52 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  25 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.79 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.88 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  24.22 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.9 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.49 
 
 
264 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2393  septum site-determining protein MinD  29.57 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000328791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2105  septum site-determining protein MinD  29.57 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000589774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.67 
 
 
211 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 
231 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.94 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
213 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
253 aa  55.8  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  33.11 
 
 
201 aa  55.8  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.55 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.48 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2449  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0538918  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.14 
 
 
257 aa  55.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  27.67 
 
 
258 aa  55.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.86 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.510804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2444  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.86 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.65 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.87 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  32.26 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  29.41 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0930  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.63 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
229 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
238 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 
212 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.44 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
215 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.12 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  23.15 
 
 
260 aa  53.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0679  septum site-determining protein  29.88 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.61 
 
 
255 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0990  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.01 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0987  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.01 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.294918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0597  septum site-determining protein MinD  29.88 
 
 
269 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.992631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  25.14 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5775  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 
222 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0846  ParA family protein  33.87 
 
 
207 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.89485  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  24.19 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
215 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 
219 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>