More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1454 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.46 
 
 
268 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.85 
 
 
267 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  40.16 
 
 
257 aa  193  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.69 
 
 
257 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  39.92 
 
 
259 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  39.15 
 
 
253 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  38.22 
 
 
256 aa  192  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.86 
 
 
270 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  39.38 
 
 
253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.22 
 
 
261 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.22 
 
 
261 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  37.45 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  38.46 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  39 
 
 
253 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.64 
 
 
253 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  38.37 
 
 
273 aa  188  7e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.37 
 
 
273 aa  188  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.21 
 
 
294 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  36.43 
 
 
268 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
274 aa  187  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  38.37 
 
 
256 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  38.37 
 
 
294 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  37.6 
 
 
253 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.41 
 
 
287 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.52 
 
 
253 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  38.76 
 
 
265 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.71 
 
 
250 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.27 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  39 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 
437 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  40.62 
 
 
330 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.93 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.35 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.3 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.85 
 
 
253 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.17 
 
 
257 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.65 
 
 
255 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.7 
 
 
253 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.93 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.08 
 
 
433 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39 
 
 
265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.74 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.61 
 
 
265 aa  182  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  38.22 
 
 
265 aa  182  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.07 
 
 
263 aa  181  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.08 
 
 
255 aa  182  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.98 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.55 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  37.55 
 
 
263 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.31 
 
 
262 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.31 
 
 
255 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.07 
 
 
256 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.55 
 
 
263 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
256 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  34.88 
 
 
256 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.34 
 
 
257 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.52 
 
 
254 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.26 
 
 
274 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.91 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.91 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.91 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  35.91 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  35.91 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  35.91 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.91 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.6 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  37.64 
 
 
257 aa  179  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  35.66 
 
 
253 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.94 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  36.29 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  37.21 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.84 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  36.68 
 
 
254 aa  178  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.64 
 
 
264 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  38.52 
 
 
361 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
470 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  38.61 
 
 
265 aa  178  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.16 
 
 
293 aa  178  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  39.46 
 
 
370 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.68 
 
 
262 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.82 
 
 
303 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  36.78 
 
 
257 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.15 
 
 
263 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.47 
 
 
256 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.84 
 
 
255 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.06 
 
 
336 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  36.58 
 
 
262 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.11 
 
 
253 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
259 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>