More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2407 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  100 
 
 
464 aa  962    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1916  ParA family protein  60.57 
 
 
467 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1768  ParA family protein  53.56 
 
 
466 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0448831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1889  chromosome partitioning ATPase  52.27 
 
 
466 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000177621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3029  chromosome partitioning ATPase  52.38 
 
 
457 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1254  chromosome partitioning ATPase  51.95 
 
 
457 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000381777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1849  ParA family protein  51.84 
 
 
469 aa  486  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.163718  normal  0.831565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1671  chromosome partitioning ATPase  42.83 
 
 
471 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000001751  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.89 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  35.71 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  37.09 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.85 
 
 
263 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  31.79 
 
 
256 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.79 
 
 
256 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
268 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 
270 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 
329 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
263 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 
297 aa  64.3  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2477  conjugal plasmid transfer ATPase  24.52 
 
 
256 aa  63.9  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  28.51 
 
 
284 aa  63.9  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  31.82 
 
 
262 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
317 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  29.36 
 
 
265 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  29.36 
 
 
265 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  33.33 
 
 
264 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  35.14 
 
 
255 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
282 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 
268 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  35.37 
 
 
265 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 
260 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
257 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.49 
 
 
257 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 
329 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.67 
 
 
256 aa  60.1  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  32.03 
 
 
273 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
263 aa  60.1  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  31.12 
 
 
268 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 
277 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.18 
 
 
293 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
263 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
259 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  31.85 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
272 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  28.35 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
293 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.44 
 
 
290 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.78 
 
 
277 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 
254 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 
263 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.78 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
253 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
264 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
270 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.96 
 
 
263 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
299 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  29.7 
 
 
285 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 
253 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2950  hypothetical protein  29.53 
 
 
256 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  27.56 
 
 
265 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
306 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 
252 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2804  hypothetical protein  29.53 
 
 
256 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  32.28 
 
 
256 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.43 
 
 
255 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 
263 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  27.72 
 
 
258 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
257 aa  57.4  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
259 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D24  ATPase for chromosome partitioning  28.95 
 
 
269 aa  57.4  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0126425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
259 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.29 
 
 
258 aa  57  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 
261 aa  57.4  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
312 aa  57.4  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  30.72 
 
 
370 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  33.77 
 
 
264 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
303 aa  57  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.77 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  29.5 
 
 
263 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  34.25 
 
 
260 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
258 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
264 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  28.72 
 
 
273 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
266 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 
259 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  31.76 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 
273 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.93 
 
 
260 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  28.5 
 
 
257 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.25 
 
 
260 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
263 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  28.87 
 
 
257 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.26 
 
 
259 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>