More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1768 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1768  ParA family protein  100 
 
 
466 aa  967    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0448831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1889  chromosome partitioning ATPase  64.73 
 
 
466 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000177621  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1849  ParA family protein  77.2 
 
 
469 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.163718  normal  0.831565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3029  chromosome partitioning ATPase  60.43 
 
 
457 aa  588  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1254  chromosome partitioning ATPase  60.22 
 
 
457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000381777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1916  ParA family protein  52.92 
 
 
467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  53.56 
 
 
464 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1671  chromosome partitioning ATPase  47.08 
 
 
471 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000001751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.91 
 
 
293 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
261 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
255 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
297 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.04 
 
 
293 aa  60.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  28.45 
 
 
264 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
253 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 
253 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
262 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.41 
 
 
268 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 
259 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.21 
 
 
264 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.87 
 
 
262 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.71 
 
 
249 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  29.02 
 
 
258 aa  56.6  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
260 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
261 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  26.91 
 
 
254 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  27.57 
 
 
293 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.91 
 
 
262 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  30.37 
 
 
260 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  32.21 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  28.65 
 
 
262 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.69 
 
 
263 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.87 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.64 
 
 
282 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
263 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
263 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  29.84 
 
 
256 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.84 
 
 
256 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 
257 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  31.43 
 
 
211 aa  53.5  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.87 
 
 
306 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
287 aa  53.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.73 
 
 
256 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
263 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.95 
 
 
279 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 
263 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  28.31 
 
 
256 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.44 
 
 
270 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  28.5 
 
 
259 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  32 
 
 
273 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.77 
 
 
265 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
263 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
263 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  28.3 
 
 
259 aa  53.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
263 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.83 
 
 
263 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  30.38 
 
 
265 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  27.84 
 
 
263 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1105  putative plasmid partition protein  25.42 
 
 
407 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.316048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  27.13 
 
 
257 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
284 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.5 
 
 
265 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.95 
 
 
317 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  27.86 
 
 
253 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.87 
 
 
263 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.75 
 
 
367 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  30.38 
 
 
265 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  25.54 
 
 
257 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  29.73 
 
 
262 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  27.98 
 
 
259 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.53 
 
 
314 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 
282 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  28.35 
 
 
262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.76 
 
 
258 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.74 
 
 
298 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  28.35 
 
 
262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 
303 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.36 
 
 
299 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
257 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.81 
 
 
257 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.76 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 
329 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  30.41 
 
 
262 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3098  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 
290 aa  51.2  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  25.33 
 
 
265 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
270 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.26 
 
 
263 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  30.04 
 
 
284 aa  51.2  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.07 
 
 
273 aa  50.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  27.84 
 
 
262 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.4 
 
 
282 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 
259 aa  50.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.19 
 
 
268 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0556  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.72 
 
 
220 aa  50.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
309 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
262 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
317 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>