More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1889 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1768  ParA family protein  64.73 
 
 		 466 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0448831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1849  ParA family protein  65.16 
 
 		 469 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.163718  normal  0.831565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3029  chromosome partitioning ATPase  66.74 
 
 		 457 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1889  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 		 466 aa  966    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000177621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1254  chromosome partitioning ATPase  66.09 
 
 		 457 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000381777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1916  ParA family protein  52.33 
 
 		 467 aa  501  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  52.27 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1671  chromosome partitioning ATPase  44.92 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000001751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.74 
 
 		 262 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 297 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  28.65 
 
 		 262 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  30.26 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.26 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.41 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1641  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.46 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  28.72 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.72 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.8 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.19 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  33.55 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  28.11 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.08 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.23 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3204  ParA family protein  25.26 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  31.98 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.78 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.29 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.56 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2157  putative plasmid partitioning protein  29.74 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 		 268 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.55 
 
 		 257 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  33.56 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.97 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.57 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  27.69 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1205  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  27.69 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.922179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.6 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  28.31 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.26 
 
 		 263 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.018865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  25.21 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 		 272 aa  57  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  29.93 
 
 		 256 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 352 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  26.94 
 
 		 259 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.74 
 
 		 263 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1372  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.74 
 
 		 263 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.167062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  25.71 
 
 		 260 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.93 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.49 
 
 		 211 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  24.58 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  31.97 
 
 		 265 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 		 268 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 287 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  25.35 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.57 
 
 		 257 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  32.45 
 
 		 314 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.11 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 		 264 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.93 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.55 
 
 		 263 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011722  BbuZS7_N36  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  31.18 
 
 		 251 aa  54.7  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 309 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  32.67 
 
 		 319 aa  54.7  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  26.64 
 
 		 392 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  25.33 
 
 		 294 aa  54.7  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 		 302 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  30.41 
 
 		 253 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 		 317 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  27.84 
 
 		 259 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 		 260 aa  54.3  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 		 249 aa  54.3  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  29.08 
 
 		 254 aa  54.3  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  24.15 
 
 		 257 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 		 282 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.59 
 
 		 261 aa  53.9  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 257 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 		 367 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>