More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1916 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1916  ParA family protein  100 
 
 
467 aa  970    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  60.57 
 
 
464 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1849  ParA family protein  56.25 
 
 
469 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.163718  normal  0.831565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1768  ParA family protein  52.92 
 
 
466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0448831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1254  chromosome partitioning ATPase  51.52 
 
 
457 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000381777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1889  chromosome partitioning ATPase  52.33 
 
 
466 aa  501  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000177621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3029  chromosome partitioning ATPase  51.52 
 
 
457 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1671  chromosome partitioning ATPase  42.79 
 
 
471 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000001751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.59 
 
 
263 aa  64.3  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
268 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 
293 aa  63.5  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  37.09 
 
 
264 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.1 
 
 
262 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  29.03 
 
 
264 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.76 
 
 
276 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
273 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  31.77 
 
 
260 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  27.97 
 
 
265 aa  60.1  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  27.97 
 
 
265 aa  60.1  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.91 
 
 
262 aa  60.1  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.55 
 
 
260 aa  60.1  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  36.55 
 
 
260 aa  60.1  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.65 
 
 
249 aa  59.7  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  26.69 
 
 
258 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.23 
 
 
265 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  30.63 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.11 
 
 
264 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.12 
 
 
297 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 
261 aa  58.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  31.76 
 
 
255 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
277 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.83 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  34 
 
 
253 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
264 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
270 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
258 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.03 
 
 
262 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0990  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.15 
 
 
265 aa  57  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37153  normal  0.791697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.31 
 
 
259 aa  56.6  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  29.03 
 
 
259 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 
264 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
255 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.98 
 
 
263 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.45 
 
 
264 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.32 
 
 
259 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 
282 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.67 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  31.29 
 
 
256 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  26.8 
 
 
262 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  29.41 
 
 
268 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.9 
 
 
262 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.26 
 
 
265 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
282 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  28.85 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.29 
 
 
256 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
272 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  26.4 
 
 
262 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.57 
 
 
259 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  26.57 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1153  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
258 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.488153  normal  0.157692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  31.08 
 
 
262 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
255 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 
312 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  32.89 
 
 
262 aa  54.7  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.45 
 
 
279 aa  54.7  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.87 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1276  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.69 
 
 
317 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.86 
 
 
256 aa  53.9  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.56 
 
 
265 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  26.97 
 
 
265 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.26 
 
 
262 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  26.03 
 
 
284 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  23.83 
 
 
258 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
284 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.26 
 
 
262 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3098  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
290 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
314 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  25.26 
 
 
262 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
252 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 
263 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 
263 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.76 
 
 
261 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.52 
 
 
263 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.67 
 
 
266 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.86 
 
 
263 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  22.73 
 
 
238 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 
263 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.6 
 
 
241 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  27.92 
 
 
270 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
263 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 
329 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.07 
 
 
287 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.84 
 
 
265 aa  52  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  24.1 
 
 
262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.43 
 
 
270 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.75 
 
 
276 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.73 
 
 
295 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.38 
 
 
367 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>