More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1849 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1768  ParA family protein  77.2 
 
 		 466 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0448831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1849  ParA family protein  100 
 
 		 469 aa  969    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.163718  normal  0.831565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1889  chromosome partitioning ATPase  65.16 
 
 		 466 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000177621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1254  chromosome partitioning ATPase  58.71 
 
 		 457 aa  578  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000381777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3029  chromosome partitioning ATPase  58.28 
 
 		 457 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1916  ParA family protein  56.25 
 
 		 467 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2407  ParA family protein  51.84 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1671  chromosome partitioning ATPase  45.81 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000001751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.52 
 
 		 249 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  28.95 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.64 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.11 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  27.99 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  32.67 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 		 261 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.7 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.48 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  32.14 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.91 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.85 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.69 
 
 		 367 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1856  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.42 
 
 		 260 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.925256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.72 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.69 
 
 		 268 aa  56.6  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  30.19 
 
 		 259 aa  56.6  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.72 
 
 		 312 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  27.95 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 		 329 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  27.98 
 
 		 258 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.1 
 
 		 270 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  32.45 
 
 		 315 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2422  ParaA family ATPase  26.91 
 
 		 254 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.95 
 
 		 282 aa  54.3  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  34.42 
 
 		 314 aa  54.3  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.71 
 
 		 211 aa  54.3  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.83 
 
 		 298 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  26.54 
 
 		 258 aa  53.9  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 		 259 aa  53.5  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  31.61 
 
 		 259 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  34 
 
 		 319 aa  53.5  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  33.12 
 
 		 260 aa  53.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.12 
 
 		 260 aa  53.5  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.62 
 
 		 279 aa  53.5  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.68 
 
 		 289 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  26.58 
 
 		 254 aa  53.5  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.61 
 
 		 276 aa  53.5  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  27.98 
 
 		 259 aa  53.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.15 
 
 		 287 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 306 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.25 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 		 263 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 		 252 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25.84 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 		 263 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  28.35 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.67 
 
 		 329 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  28.8 
 
 		 260 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1384  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.18 
 
 		 263 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.67 
 
 		 256 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  30.67 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 		 317 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 		 262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  28.8 
 
 		 256 aa  52  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  29.29 
 
 		 263 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  27.47 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  30.29 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC19  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  31.13 
 
 		 246 aa  51.6  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.433322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 258 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1460  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 263 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 263 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2913  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 263 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67187  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  26.79 
 
 		 256 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.75 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3045  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 263 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  27.46 
 
 		 259 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 		 284 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  24.23 
 
 		 258 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  30 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  30 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.73 
 
 		 257 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>