More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0223 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  100 
 
 
284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.41 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.03 
 
 
282 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3541  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.86 
 
 
285 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555008  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.05 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.09 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.96 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 
300 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.16 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.6 
 
 
269 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.81 
 
 
254 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0348907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.49 
 
 
298 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
257 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.1 
 
 
313 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
269 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 
315 aa  99.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000594465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.81 
 
 
313 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
264 aa  99  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
299 aa  99  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.37 
 
 
352 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  28.72 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  30.54 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  28.01 
 
 
253 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  31.25 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.4 
 
 
256 aa  95.5  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 
299 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  31 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.76 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  29.54 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
262 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.01 
 
 
362 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  28.07 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 
287 aa  94  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.71 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.04 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 
293 aa  92.8  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.72 
 
 
257 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.54 
 
 
367 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
273 aa  92.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.52 
 
 
279 aa  92.4  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 
294 aa  92.4  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  29.09 
 
 
259 aa  92  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  29.46 
 
 
256 aa  92  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  29.8 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  31.92 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2993  chromosome partitioning ATPase  29.18 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.09 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.22 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.22 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.22 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  28.27 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.22 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.22 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.51 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.22 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.18 
 
 
298 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.22 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.98 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.64 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  30.52 
 
 
318 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  27.24 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  30 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
339 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  31.3 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.1 
 
 
260 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  30.71 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.48 
 
 
281 aa  89  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.94 
 
 
264 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  27.92 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.67 
 
 
254 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  35.75 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  28.01 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 
322 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.06 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.75 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.63 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.81 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B12  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.56 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.042281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>