More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1454 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  100 
 
 
258 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.04 
 
 
259 aa  322  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.65 
 
 
257 aa  320  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.16 
 
 
254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  59.77 
 
 
254 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.09 
 
 
255 aa  314  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.77 
 
 
254 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.16 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.55 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.16 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.16 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.38 
 
 
254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.38 
 
 
254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.98 
 
 
254 aa  311  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.37 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.69 
 
 
255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.27 
 
 
265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.75 
 
 
254 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  56.37 
 
 
255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  55.98 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.76 
 
 
257 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.37 
 
 
257 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.04 
 
 
256 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.83 
 
 
259 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  55.98 
 
 
257 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  54.44 
 
 
259 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.98 
 
 
257 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.47 
 
 
256 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  52.51 
 
 
256 aa  261  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.35 
 
 
258 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.74 
 
 
258 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.35 
 
 
263 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  51.35 
 
 
263 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.79 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  33.33 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  36.67 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  32.64 
 
 
264 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.78 
 
 
282 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  33.6 
 
 
265 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  33.6 
 
 
265 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.89 
 
 
346 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  32.56 
 
 
270 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.77 
 
 
273 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.23 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
262 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 
284 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.23 
 
 
284 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.25 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  35.14 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.22 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.06 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  32.55 
 
 
259 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  32.78 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  35.27 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  34.17 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.31 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
303 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  33.73 
 
 
308 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.83 
 
 
259 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.77 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  37.14 
 
 
341 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 
263 aa  111  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 
266 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
294 aa  111  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  32.93 
 
 
347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.78 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.98 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.78 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  30.99 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.83 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
286 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
317 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.59 
 
 
257 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  33.98 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.98 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.51 
 
 
276 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
255 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  30.59 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1408  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.391626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  32.65 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 
262 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.57 
 
 
282 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 
260 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>