More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1920 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
258 aa  527  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.51 
 
 
258 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.96 
 
 
263 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  94.19 
 
 
263 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.77 
 
 
257 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  69.38 
 
 
259 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  71.76 
 
 
255 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  71.37 
 
 
255 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.99 
 
 
257 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  69.38 
 
 
257 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.48 
 
 
256 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.99 
 
 
257 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.83 
 
 
259 aa  361  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  67.32 
 
 
256 aa  357  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.9 
 
 
256 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.59 
 
 
259 aa  297  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.27 
 
 
255 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.86 
 
 
257 aa  279  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.37 
 
 
254 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.37 
 
 
254 aa  278  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.3 
 
 
255 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.17 
 
 
254 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.2 
 
 
254 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.54 
 
 
265 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.3 
 
 
254 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.94 
 
 
254 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.94 
 
 
254 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.94 
 
 
254 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.69 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  54.72 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 
254 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.74 
 
 
263 aa  261  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  51.35 
 
 
258 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  32.95 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.73 
 
 
257 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.45 
 
 
294 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.16 
 
 
257 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  34.62 
 
 
265 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.66 
 
 
318 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  35.5 
 
 
253 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.71 
 
 
253 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  33.99 
 
 
259 aa  122  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  34.65 
 
 
264 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.05 
 
 
256 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  31.45 
 
 
294 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
284 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  31.85 
 
 
335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  31.85 
 
 
333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  31.85 
 
 
335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  30.23 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.73 
 
 
336 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  31.76 
 
 
262 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.62 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  35.56 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  32.68 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.19 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.19 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  34.58 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.41 
 
 
259 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  35.41 
 
 
275 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.19 
 
 
271 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  32.35 
 
 
256 aa  116  3e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  30.28 
 
 
258 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.41 
 
 
259 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  33.48 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.42 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 
314 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
264 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  35.58 
 
 
264 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.48 
 
 
256 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  34.11 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  34.11 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.48 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  32.49 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.47 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.89 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.27 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  36.41 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  32.26 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.49 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.23 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  30.8 
 
 
261 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.06 
 
 
270 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  29.62 
 
 
260 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.75 
 
 
264 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.36 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.33 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  34.32 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>