More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6545 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.61 
 
 
254 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  86.22 
 
 
254 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.22 
 
 
254 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  86.61 
 
 
254 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  86.22 
 
 
254 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  85.1 
 
 
255 aa  454  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  85.43 
 
 
254 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  86.22 
 
 
254 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.13 
 
 
254 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  82.68 
 
 
254 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.05 
 
 
255 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  69.08 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.75 
 
 
259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.38 
 
 
254 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.34 
 
 
263 aa  346  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.35 
 
 
265 aa  324  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  59.77 
 
 
258 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.08 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  62.6 
 
 
255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.32 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.81 
 
 
257 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.42 
 
 
256 aa  304  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  62.2 
 
 
255 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.42 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  59.6 
 
 
259 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  61.02 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.63 
 
 
257 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  58 
 
 
256 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.12 
 
 
258 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  54.72 
 
 
263 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.72 
 
 
258 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.94 
 
 
263 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.38 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  35.46 
 
 
253 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  34.66 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
253 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  32.27 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.92 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  35.66 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.66 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  33.46 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  32.54 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  33.07 
 
 
257 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.39 
 
 
257 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  32.27 
 
 
257 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  33.07 
 
 
257 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.09 
 
 
260 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.8 
 
 
315 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  33.07 
 
 
273 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.92 
 
 
270 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  33.07 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  33.6 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
276 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.88 
 
 
264 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  32.81 
 
 
264 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.65 
 
 
318 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.52 
 
 
277 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  31.23 
 
 
264 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  35.5 
 
 
341 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.23 
 
 
264 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.62 
 
 
264 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.65 
 
 
346 aa  121  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  30.2 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.08 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  32.3 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.47 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.81 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  32.41 
 
 
251 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  34.24 
 
 
330 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
335 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
335 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  31.1 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  32.27 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.99 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.73 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  31.75 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.87 
 
 
462 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 
253 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  30.68 
 
 
264 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.67 
 
 
253 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>