More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2693 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
254 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
254 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  95.67 
 
 
254 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  95.28 
 
 
254 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.88 
 
 
254 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.88 
 
 
254 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  92.52 
 
 
254 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  86.61 
 
 
254 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  83.07 
 
 
254 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  83 
 
 
254 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.78 
 
 
255 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.75 
 
 
255 aa  370  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.44 
 
 
254 aa  367  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  66.4 
 
 
259 aa  351  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.07 
 
 
257 aa  344  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.4 
 
 
263 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.24 
 
 
265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  62.8 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  59.38 
 
 
258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  62.4 
 
 
255 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.18 
 
 
259 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.4 
 
 
257 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.47 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  60.87 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.6 
 
 
256 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.2 
 
 
257 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  61.2 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.8 
 
 
257 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  59.2 
 
 
256 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.77 
 
 
258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  57.37 
 
 
263 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.37 
 
 
258 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.57 
 
 
263 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.73 
 
 
273 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
255 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  33.73 
 
 
253 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.55 
 
 
253 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
293 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  31.52 
 
 
270 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  30.83 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.37 
 
 
293 aa  118  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  31.35 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  30.83 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  30.04 
 
 
348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
274 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
274 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 
259 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.03 
 
 
257 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  32.54 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.12 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  33.59 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.62 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.98 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  31.78 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  32.02 
 
 
254 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.6 
 
 
318 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.4 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.4 
 
 
362 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 
330 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.8 
 
 
260 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  29.12 
 
 
257 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  37.8 
 
 
260 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.37 
 
 
258 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.68 
 
 
277 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  29.12 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.35 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  29.92 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  31.35 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.89 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 
255 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.23 
 
 
352 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
263 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
315 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
262 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.5 
 
 
260 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  31.1 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  29.69 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
254 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 
264 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
254 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
299 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  30.95 
 
 
262 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  31.25 
 
 
258 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  33.46 
 
 
305 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  33.72 
 
 
341 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.23 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>