More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4943 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  99.22 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  98.44 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  96.5 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  89.02 
 
 		 256 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  88.33 
 
 		 259 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  87.94 
 
 		 259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  87.01 
 
 		 255 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  86.61 
 
 		 255 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  86.56 
 
 		 256 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  78.74 
 
 		 256 aa  411  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  68.99 
 
 		 263 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.99 
 
 		 263 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.99 
 
 		 258 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.6 
 
 		 258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.35 
 
 		 255 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.29 
 
 		 265 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.71 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.8 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.29 
 
 		 257 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.8 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.8 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.63 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.42 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.4 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.4 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.14 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60 
 
 		 254 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  57.2 
 
 		 254 aa  291  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.89 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.27 
 
 		 263 aa  287  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  55.98 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30.28 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.47 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.87 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  33.01 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  34.65 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.15 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  34.65 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.23 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  33.66 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  30.62 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  30.62 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  30.62 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  30.38 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  31.32 
 
 		 347 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  30.38 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  28.79 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.99 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  32.18 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.62 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.02 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 		 294 aa  108  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  28.93 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  32.21 
 
 		 283 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.12 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  34.65 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  31.05 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.64 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  30.42 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.52 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  32.37 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.3 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.16 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  30.59 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  28.85 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.31 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.47 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.12 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  31.38 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  29.57 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  28.63 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  32.77 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  30.24 
 
 		 348 aa  106  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.04 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.37 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  31.34 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  33.65 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.55 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>