More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0442 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
256 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  89.8 
 
 
257 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  89.41 
 
 
257 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  89.8 
 
 
257 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  89.37 
 
 
259 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  89.02 
 
 
257 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  88.58 
 
 
259 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  87.35 
 
 
256 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  87.4 
 
 
255 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  86.61 
 
 
255 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  77.34 
 
 
256 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.48 
 
 
258 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.48 
 
 
258 aa  357  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  67.32 
 
 
263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.32 
 
 
263 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.99 
 
 
255 aa  328  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.68 
 
 
259 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.68 
 
 
265 aa  315  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.29 
 
 
257 aa  308  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.84 
 
 
255 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.22 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.47 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.87 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.47 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.08 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.68 
 
 
254 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.68 
 
 
254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.29 
 
 
254 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.29 
 
 
254 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  58.1 
 
 
254 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.4 
 
 
263 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.92 
 
 
254 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  55.04 
 
 
258 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.27 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.47 
 
 
258 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  35.08 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  35.15 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.68 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
262 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.14 
 
 
253 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  31.78 
 
 
265 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  31.78 
 
 
265 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 
256 aa  122  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  29.96 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  32.26 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
253 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  30.65 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 
256 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 
256 aa  119  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  31.45 
 
 
258 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  31.17 
 
 
294 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  30.92 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  31.45 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 
253 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.13 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.66 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  30.83 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  31.85 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  29.03 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.67 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.67 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.92 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.67 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.83 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.67 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.67 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.67 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.67 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  31.3 
 
 
261 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
257 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  29.92 
 
 
254 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  32.41 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  34.44 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  32.17 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.24 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.12 
 
 
264 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  29.67 
 
 
256 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
314 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  28.8 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.61 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  30.49 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  29.55 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.69 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 
304 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
276 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.08 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>