More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0468 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 254 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.91 
 
 		 255 aa  384  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.33 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  69.57 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  72.44 
 
 		 254 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.44 
 
 		 254 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.94 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  71.94 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  71.94 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.59 
 
 		 255 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  70.08 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  68.9 
 
 		 254 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.11 
 
 		 254 aa  352  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  68.38 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.43 
 
 		 257 aa  325  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.16 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.89 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  60.08 
 
 		 255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  58.75 
 
 		 258 aa  298  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.84 
 
 		 256 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.92 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  57.31 
 
 		 256 aa  291  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.89 
 
 		 257 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  57.71 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.89 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.5 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  58.5 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.92 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.69 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.69 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  54.33 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.12 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.3 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  30.23 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  31.35 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  31.35 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  31.35 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.86 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  32.26 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 		 262 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.54 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  30.53 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  30.95 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  30.08 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  31.78 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  30.16 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  29.8 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.02 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.02 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  34.02 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.02 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  34.02 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.2 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  30.31 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.52 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  32 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32.51 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  32.26 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.16 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  30.38 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  30.36 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.94 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  34.01 
 
 		 341 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 259 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  32.31 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.22 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.79 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.33 
 
 		 470 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.75 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  31.43 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.61 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  30.68 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.64 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.14 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.85 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.74 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  31.6 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.74 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.65 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  34.16 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.95 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>