More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2229 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  94.47 
 
 
254 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  84.13 
 
 
254 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.94 
 
 
254 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  83 
 
 
254 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  83 
 
 
254 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.14 
 
 
254 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.14 
 
 
254 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  81.75 
 
 
254 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  80.24 
 
 
255 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  79.84 
 
 
254 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  72.33 
 
 
255 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  67.98 
 
 
259 aa  363  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  68.11 
 
 
254 aa  352  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  67.07 
 
 
257 aa  349  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  63.28 
 
 
263 aa  335  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.06 
 
 
265 aa  326  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  60.16 
 
 
258 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  60.8 
 
 
255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.22 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  60 
 
 
255 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.29 
 
 
259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.4 
 
 
257 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  58.89 
 
 
259 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  59.2 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.8 
 
 
257 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.6 
 
 
256 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.4 
 
 
257 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  55.6 
 
 
256 aa  281  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.86 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  54.3 
 
 
263 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.3 
 
 
258 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  53.52 
 
 
263 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  33.99 
 
 
253 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.94 
 
 
294 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  33.98 
 
 
273 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
255 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  33.72 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  32.55 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  32.41 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  33.2 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  31.27 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
262 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  33.33 
 
 
347 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  33.33 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  32.81 
 
 
333 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  32.81 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  32.81 
 
 
335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.99 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
289 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 
257 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.94 
 
 
274 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.6 
 
 
264 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
346 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  32.02 
 
 
348 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  32.94 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.81 
 
 
253 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  31.75 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.68 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  32.41 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.01 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.16 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.58 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.98 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.08 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  31.89 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  32.14 
 
 
266 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.54 
 
 
270 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.31 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.94 
 
 
255 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
262 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.58 
 
 
284 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  32.42 
 
 
293 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
257 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  31.5 
 
 
260 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.63 
 
 
257 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  32.16 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.62 
 
 
276 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.98 
 
 
253 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.11 
 
 
255 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.24 
 
 
315 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.07 
 
 
336 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  32.42 
 
 
265 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  34.09 
 
 
341 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
260 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  31.13 
 
 
265 aa  123  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.98 
 
 
253 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
263 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
257 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>