More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4974 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  81.5 
 
 
276 aa  424  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  34.8 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 
360 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.96 
 
 
360 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
358 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  29.28 
 
 
361 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 
359 aa  95.9  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
286 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.7 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.89 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.14 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.57 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  30.99 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  28.41 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  25.35 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.14 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.99 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  28.38 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  25.9 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.78 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.95 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.97 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  27.82 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6315  plasmid partitioning ATPase ParA  27.57 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  26.44 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.96 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.9 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.2 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.34 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.72 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  31.25 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.35 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.44 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  28.65 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  27.76 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.12 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  31.16 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.09 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.91 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  29.63 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  25.65 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  25.65 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  25.65 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.84 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3070  ParA-like chromosome partition protein  28.84 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  24.91 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  29.57 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.79 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  26.3 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  26.89 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  27.83 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.16 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.75 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  25.95 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.35 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  31.18 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  29.94 
 
 
345 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.94 
 
 
253 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.42 
 
 
322 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.52 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  25.68 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  27.03 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  31.18 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0556  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.61 
 
 
220 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.29 
 
 
257 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  29.05 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.82 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.52 
 
 
298 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  24.6 
 
 
332 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 
257 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  28.77 
 
 
264 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.83 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.83 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.95 
 
 
264 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  30.9 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.42 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  29.65 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>