More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6445 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  94.17 
 
 
360 aa  695    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
360 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  88.06 
 
 
358 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.77 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  51.24 
 
 
361 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  36.36 
 
 
294 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.24 
 
 
262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.46 
 
 
260 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
282 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 
276 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.9 
 
 
280 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.87 
 
 
284 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.84 
 
 
259 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  31.2 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
281 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  28.11 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.65 
 
 
255 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.23 
 
 
265 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  28.11 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.49 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.96 
 
 
268 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.15 
 
 
258 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.28 
 
 
264 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  34.54 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  27.1 
 
 
261 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.98 
 
 
328 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  29.49 
 
 
258 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.42 
 
 
250 aa  86.7  6e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 
264 aa  86.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  29.83 
 
 
264 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.6 
 
 
257 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.6 
 
 
267 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.68 
 
 
265 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  34.21 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  29.22 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  28.35 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.45 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  31.19 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
258 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  32.98 
 
 
330 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.39 
 
 
256 aa  84  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.29 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  31.61 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.57 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.04 
 
 
433 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.19 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1227  chromosome segregation ATPase  31.78 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2798  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.65 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.519748  normal  0.161878 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.07 
 
 
266 aa  82.4  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.91 
 
 
267 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2888  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.78 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.54 
 
 
263 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  32.12 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.63 
 
 
437 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.1 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.38 
 
 
255 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  29.11 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.33 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.1 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.11 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1474  chromosome partitioning protein  30.1 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.26 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  31.73 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  29.74 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  30.43 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.46 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  28.94 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.7 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  30.7 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  26.74 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  33.16 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.25 
 
 
254 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3864  putative plasmid partitioning protein  27.39 
 
 
262 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  29.41 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
265 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.59 
 
 
259 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.8 
 
 
249 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.98 
 
 
259 aa  79.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  28.5 
 
 
293 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45520  putative plasmid partitioning protein  26.55 
 
 
262 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.922179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>