More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0782 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
281 aa  570  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.74 
 
 
286 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  32.95 
 
 
294 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.21 
 
 
260 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
360 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
358 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.16 
 
 
246 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  31.43 
 
 
361 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  40 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.15 
 
 
360 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  35.79 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
359 aa  95.5  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.89 
 
 
278 aa  92.8  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  33.68 
 
 
294 aa  92  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  33.16 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  27.27 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.16 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.66 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  26.29 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.61 
 
 
262 aa  90.1  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  26.94 
 
 
260 aa  89  8e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.97 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  31.98 
 
 
259 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  30 
 
 
264 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 
279 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  32.63 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  31.49 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.87 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.49 
 
 
304 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  28.85 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.93 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.93 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  32.64 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  28.85 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.93 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  31.93 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.93 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.51 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.293601  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.19 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  31.93 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.93 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.05 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  35.05 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.05 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  29.29 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.83 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.37 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.16 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.22 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.55 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.81 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  32.8 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  33.51 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  33.51 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  27.92 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.51 
 
 
256 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  31.14 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.16 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002021  ParA family protein  33.85 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000141399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  31.54 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  31.38 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  34.36 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  30.53 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.42 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.81 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.43 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  29.47 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.53 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.09 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3068  chromosome partitioning protein, sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.82 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.11 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.46 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>