More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0038 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  100 
 
 		 361 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.8 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.41 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.24 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.65 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  34.84 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.86 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.95 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.73 
 
 		 250 aa  116  6.9999999999999995e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  32.7 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.68 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 		 246 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.24 
 
 		 265 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 		 257 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.12 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  33.82 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.82 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  31.03 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.47 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  28.24 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  35.15 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  35.15 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  35.15 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  31.4 
 
 		 262 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 392 aa  99.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.29 
 
 		 264 aa  99.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.97 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9384  chromosome partitioning protein; transcriptional regulator  29.96 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  28.14 
 
 		 258 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  31.3 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 258 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  30.31 
 
 		 266 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 287 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.96 
 
 		 259 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 		 264 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.63 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.72 
 
 		 318 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 		 257 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 294 aa  95.9  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2155  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.75 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.426789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  28.39 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.81 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.12 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.18 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 274 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3517  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 		 263 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 		 270 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4237  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 		 304 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  27.41 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.06 
 
 		 348 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.05 
 
 		 257 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.05 
 
 		 257 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 		 284 aa  94  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.26 
 
 		 260 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  29.96 
 
 		 259 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  30.52 
 
 		 323 aa  92.8  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  29.17 
 
 		 266 aa  92.8  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 		 262 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.07 
 
 		 303 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  27.73 
 
 		 258 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  27.42 
 
 		 333 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 		 257 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.57 
 
 		 268 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 269 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  29.92 
 
 		 253 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 		 272 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 		 257 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  32.3 
 
 		 255 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  30.48 
 
 		 264 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 		 293 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 		 255 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  28.57 
 
 		 259 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  29.5 
 
 		 257 aa  90.1  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  31.2 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 		 262 aa  90.1  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 		 285 aa  90.1  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.2 
 
 		 263 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3373  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 		 267 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.12 
 
 		 256 aa  89.7  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  29.12 
 
 		 256 aa  90.1  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0114  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.91 
 
 		 262 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 		 259 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  29.06 
 
 		 262 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.9 
 
 		 257 aa  89.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  30 
 
 		 258 aa  89.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>