More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0014 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.34 
 
 		 360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.97 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.43 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.57 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  34.84 
 
 		 361 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.72 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.8 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.72 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4937  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.2 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0647563  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.93 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  30.15 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  23.35 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.16 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.14 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.5 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  36.46 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.75 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  35.29 
 
 		 370 aa  99.4  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.61 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  34.27 
 
 		 257 aa  99  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.96 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  34.19 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 		 263 aa  96.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  33.01 
 
 		 257 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  37.93 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.65 
 
 		 253 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  31.75 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  32.95 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.32 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.77 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 		 257 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  33.2 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  32.75 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  33.65 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  33.17 
 
 		 258 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  32.64 
 
 		 261 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.14 
 
 		 260 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.76 
 
 		 251 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  33.05 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.05 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 		 258 aa  92.4  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.96 
 
 		 262 aa  92.4  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  33.17 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 		 270 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.91 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.69 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.07 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.92 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.9 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.5 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  30.45 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  30.57 
 
 		 253 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  37.35 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.38 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  33.49 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.38 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  29.82 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  33.19 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.94 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.64 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  29.8 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.39 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  32.39 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 		 259 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.38 
 
 		 259 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.52 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.14 
 
 		 392 aa  89.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  37.11 
 
 		 330 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.16 
 
 		 265 aa  89.7  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  30.93 
 
 		 265 aa  89.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.8 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  30.5 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 		 253 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.11 
 
 		 254 aa  89  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  33.79 
 
 		 348 aa  89  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.7 
 
 		 470 aa  89  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.37 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  38.1 
 
 		 335 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.18 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.96 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>