More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5812 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 		 262 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  38.43 
 
 		 294 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  31.82 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.66 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  33.86 
 
 		 361 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.35 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.77 
 
 		 314 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.43 
 
 		 358 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.24 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.89 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.9 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  32.9 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.9 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.83 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.74 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  31.25 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  34.41 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.52 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  28.75 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.31 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  27.39 
 
 		 250 aa  99  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  29.21 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.55 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  29.92 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  26.95 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  32.05 
 
 		 335 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  32.05 
 
 		 335 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  32.05 
 
 		 333 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  28.11 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  30.65 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  32.61 
 
 		 370 aa  95.9  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  31.62 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  30.28 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.46 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.91 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.09 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  29.18 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.74 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.43 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.06 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.74 
 
 		 437 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.87 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  34.36 
 
 		 347 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.42 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.49 
 
 		 294 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.04 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  26.87 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  27.52 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  29.57 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.74 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  26.15 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  32.14 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  31.88 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.26 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  30.57 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.37 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  29.06 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.82 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.92 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.21 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.55 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.71 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.72 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  29.36 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  32.61 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  27.03 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  25.29 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  27.82 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.47 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  25.77 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.59 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.72 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  29.72 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.18 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.57 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.19 
 
 		 318 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.28 
 
 		 264 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  29.74 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.38 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.87 
 
 		 303 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.38 
 
 		 268 aa  88.6  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.57 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>