More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0058 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.21 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.2 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  31.7 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  33.86 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.47 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  31.09 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  31.82 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.36 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.73 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.92 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.45 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  32.95 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.4 
 
 		 255 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.55 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  28.96 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.27 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.17 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.66 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.78 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.39 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.64 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.2 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.94 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  29.48 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 286 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  30.99 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.45 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  29.96 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  31.33 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  31.28 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.98 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.83 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.24 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.47 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.36 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  31.28 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  31.28 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  32.23 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  29.27 
 
 		 347 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  29.22 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.01 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  28.3 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 		 336 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  28.79 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.2 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  31.02 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.47 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  28.79 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.17 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  30.07 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  30.07 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  30.07 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  30.07 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  30.77 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.71 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  30.62 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.89 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  29.51 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  30.77 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  31.23 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1631  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423414  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.22 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  29.84 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  27.92 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.35 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>