More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2879 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4224  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.57 
 
 
260 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323869  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.1 
 
 
280 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.66 
 
 
360 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.73 
 
 
358 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
255 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.28 
 
 
360 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
359 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  28.79 
 
 
294 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0038  plasmid partition protein  28.4 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
257 aa  95.5  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.52 
 
 
339 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  36.63 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.13 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.35 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.77 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.35 
 
 
299 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
261 aa  92  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7000  replication protein A  26.69 
 
 
408 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.1 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 
328 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  30.2 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.44 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.22 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.67 
 
 
397 aa  89.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  28.79 
 
 
327 aa  89  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  34.35 
 
 
314 aa  89  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0049  putative ParA partition protein  29.04 
 
 
261 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3903  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.43 
 
 
262 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3430  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.89 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.65 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.14 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  29.39 
 
 
268 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 
404 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305992  normal  0.932958 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3421  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.03 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.786634  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.87 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.41 
 
 
275 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  27.56 
 
 
409 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1986  ParA family protein  29.89 
 
 
262 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  29.75 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  30.6 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.07 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  29.49 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  30.07 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.4 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
337 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.97 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.34 
 
 
303 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.78 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601038  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.58 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.46 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  30.41 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.78 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  27.38 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  31.65 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  29.22 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  27.59 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.88 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.45 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.23 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  28.37 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.96 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  26.48 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  30.77 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  26.92 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.35 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  29.74 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.28 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  27.9 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  30.88 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  29.23 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.02 
 
 
480 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.67 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8000  replication protein A  26.22 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.59 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.63 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.87 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  29.7 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  25.48 
 
 
279 aa  82  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  27.73 
 
 
256 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>