More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0556 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0556  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
220 aa  435  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  65.44 
 
 
220 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  35.26 
 
 
262 aa  96.3  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2339  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.36 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0896384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
284 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0013  chromosome partitioning protein ParA  36.97 
 
 
265 aa  93.6  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0075806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.72 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.2 
 
 
249 aa  91.7  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 
254 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.63 
 
 
480 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 
253 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1526  parA family protein  34.12 
 
 
262 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.429591  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  37.18 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  35.5 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  32.35 
 
 
265 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  32.35 
 
 
265 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.56 
 
 
266 aa  88.2  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  29.2 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.33 
 
 
264 aa  87.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  30.95 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.32 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.18 
 
 
314 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.25 
 
 
257 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  35.12 
 
 
279 aa  87  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
264 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  32.43 
 
 
254 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.22 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  35.44 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  30.91 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  32.94 
 
 
260 aa  86.3  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.81 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.44 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  36.71 
 
 
294 aa  86.3  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.22 
 
 
264 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  29.79 
 
 
260 aa  85.5  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  36.48 
 
 
264 aa  85.5  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  29.88 
 
 
250 aa  85.5  6e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 
265 aa  84.7  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  33.12 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  33.92 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  33.12 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  33.54 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  33.12 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  29.13 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.85 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  33.94 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  32.74 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.35 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.29 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.29 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  27.45 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
317 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.98 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.46 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02865  putative ParA family protein  33.33 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.34 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  33.92 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.12 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.46 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.98 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  34.3 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.08 
 
 
266 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.94 
 
 
329 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.71 
 
 
277 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.14 
 
 
303 aa  82  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.372199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  35.12 
 
 
345 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.03 
 
 
272 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  31.14 
 
 
266 aa  82  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.59 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.92 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.34 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.29 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6366  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  0.30299 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.41 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  29.06 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.41 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.75 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>