More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22160 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
309 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  33.46 
 
 
255 aa  119  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.56 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
253 aa  112  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.27 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.51 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.46 
 
 
265 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  28.4 
 
 
348 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  28.35 
 
 
255 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  30.35 
 
 
270 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
290 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
259 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
279 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.55 
 
 
264 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
290 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  32.12 
 
 
253 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  32.43 
 
 
319 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
264 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  32.32 
 
 
262 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.62 
 
 
263 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0196  chromosome partitioning protein  32.66 
 
 
256 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.62 
 
 
263 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  31.94 
 
 
262 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.58 
 
 
293 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.94 
 
 
262 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  28.63 
 
 
249 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.5 
 
 
284 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1058  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 
259 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.62 
 
 
263 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  31.94 
 
 
262 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  31.94 
 
 
262 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
258 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  31.37 
 
 
268 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
262 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.52 
 
 
256 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
262 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
262 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.32 
 
 
337 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
262 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.32 
 
 
261 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.23 
 
 
263 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  31.13 
 
 
264 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
302 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.13 
 
 
284 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
294 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.27 
 
 
303 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.02 
 
 
261 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27 
 
 
266 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.03 
 
 
298 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
256 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.72 
 
 
249 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.62 
 
 
256 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
309 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  32.43 
 
 
290 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
261 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0777  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
257 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0129955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 
299 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
303 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.17 
 
 
339 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  30 
 
 
261 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.7 
 
 
262 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  30.65 
 
 
318 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 
255 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 
269 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  33.07 
 
 
256 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.32 
 
 
264 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.41 
 
 
256 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  30.94 
 
 
314 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.41 
 
 
256 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.41 
 
 
256 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  32.41 
 
 
256 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  29.92 
 
 
262 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.41 
 
 
256 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 
271 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.41 
 
 
256 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
254 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.41 
 
 
256 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.07 
 
 
256 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.52 
 
 
367 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  30.45 
 
 
257 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.54 
 
 
293 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  29.59 
 
 
262 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  30.96 
 
 
280 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.56 
 
 
262 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  31.82 
 
 
259 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.65 
 
 
306 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  30.68 
 
 
264 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  29.34 
 
 
294 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  31.44 
 
 
276 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.89 
 
 
264 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
346 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.66 
 
 
317 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1345  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.27 
 
 
262 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  32.7 
 
 
345 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 
256 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
259 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
259 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>