97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2634 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  99.57 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  88.09 
 
 		 235 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  37.97 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  36.97 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  36.25 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  36.55 
 
 		 245 aa  134  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  38.33 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  34.87 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  34.87 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  34.87 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  34.87 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  37.92 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  37.92 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  37.92 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  38.49 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  33.91 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  34.06 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.51 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  28.69 
 
 		 262 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.94 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  30.92 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  25.1 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.74 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  25.32 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  28.33 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.5 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  19.76 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  23.67 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.6 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  35.59 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.05 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6822  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.09 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.62 
 
 		 262 aa  48.5  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.87 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  24.08 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  23.41 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  23.41 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.32 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  23.41 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11723  initiation inhibitor protein  24.5 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.11 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.62 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  26.78 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.5 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.62 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  25.62 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  23.02 
 
 		 262 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.62 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 		 311 aa  45.1  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  21.83 
 
 		 257 aa  45.1  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  26.27 
 
 		 381 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5494  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.7 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  19.05 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 		 420 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.62 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  25 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.02 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  19.01 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  19.01 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13239  hypothetical protein  27.04 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.614127  normal  0.5818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.19 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1789  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.67 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247276  normal  0.400701 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  21.67 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3173  cell division ATPase MinD  26.88 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.52 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.7 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  23.53 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  20.72 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.75 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 		 322 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  18.82 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.1 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 437 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  23.2 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.43 
 
 		 433 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0440  septum site-determining protein MinD  29.82 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.1 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.43 
 
 		 284 aa  42.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.45 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.1 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1703  septum site-determining protein MinD  27.86 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  22.73 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3043  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.89 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.025517 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0350  cell division ATPase MinD  28.21 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0402773  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2979  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.99 
 
 		 257 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5560  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.02 
 
 		 256 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.46 
 
 		 259 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  27.46 
 
 		 259 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1423  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.3 
 
 		 328 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.83 
 
 		 264 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>