65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3892 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  98.8 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  99.2 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  98.4 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  77.82 
 
 		 250 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  77.42 
 
 		 250 aa  407  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  77.82 
 
 		 250 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  77.82 
 
 		 250 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  77.08 
 
 		 242 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  76.99 
 
 		 241 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  74.69 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  56.1 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  51.63 
 
 		 245 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  50.41 
 
 		 245 aa  254  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  37.92 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  37.92 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  36.25 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  31.43 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.71 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  27.89 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.89 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  26.15 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  26.97 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  27.64 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  26.46 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.8 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  27.93 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  27.67 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.28 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  21.33 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  20.27 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  26.69 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  26.69 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  25.98 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  21.05 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2478  chromosome partitioning ATPase  26.71 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.29 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  28.38 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.21 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  25.41 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  30.46 
 
 		 789 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.52 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1991  septum site-determining protein MinD  30.47 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  27.03 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.32 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.32 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  29.32 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  26.23 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.66 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.32 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0467  cell division ATPase MinD  25.78 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.543355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.32 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  29.32 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  25.33 
 
 		 280 aa  42  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.05 
 
 		 277 aa  42  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.59 
 
 		 243 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  25.5 
 
 		 263 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A20  ATPase involved in chromosome partitioning  23.18 
 
 		 270 aa  42  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.814657  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1552  septum site-determining protein MinD  32.81 
 
 		 267 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>