More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3257 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  100 
 
 		 262 aa  524  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  70.23 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  69.47 
 
 		 262 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  37.94 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  34.39 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  36.36 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  36.84 
 
 		 381 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  35.97 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  31.35 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.95 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  30.5 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  30.77 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  31.37 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  34.72 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  33.73 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1586  putative cellulose biosynthesis protein  31.12 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476599  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0690  putative cellulose biosynthesis protein  31.12 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2012  putative cellulose biosynthesis protein  31.12 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.4 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.4 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2141  hypothetical protein  30.77 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2227  hypothetical protein  30.77 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  31.01 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  31.62 
 
 		 259 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  27.31 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  29.57 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  28.8 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.44 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.84 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002182  TCA06  virulence plasmid ParA family protein pGP5-D  24.32 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3786  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116138  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  28.57 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  28.57 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  28.74 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.35 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  30.92 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.79 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.03 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  30.43 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  29.2 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  29.2 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  29.2 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.61 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0628  hypothetical protein  29.46 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  28.19 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  28.8 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.32 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  28.19 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.46 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  29.46 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  30.96 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.68 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.96 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.02 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.96 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.95 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  30.98 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  28.69 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.09 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.09 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  27.13 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.8 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  29.67 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  24.91 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.07 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  29.2 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.59 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  30 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.56 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.27 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.58 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  28.8 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  28.4 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.34 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  26.12 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  27.13 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4334  ParA family protein  28.29 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.873064  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  28.34 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1533  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.344504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  28.51 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  29.46 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3660  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.53 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.21 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.98 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.8 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  29.17 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.9 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>