More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3896 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  84.73 
 
 		 271 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  67.95 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  49.43 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  35.55 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  34.39 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  35.16 
 
 		 262 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  28.4 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  31.67 
 
 		 381 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  25 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  24.58 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  26.97 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  26.97 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  26.97 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  26.97 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  26.97 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  27.16 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  27.16 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  27.16 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  27.16 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  27.16 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  26.72 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.96 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  26.25 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  28.12 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  28.29 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.63 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  27.63 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_011736  BbuZS7_R32  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  25.11 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00448287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  27.34 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.1 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  26.79 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0796  cellulose biosynthesis protein, putative  28.24 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417573  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.75 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  28.33 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  26.79 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  25.65 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2164  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.441053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2546  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.38 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.34 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.33 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  28.24 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1586  putative cellulose biosynthesis protein  27.92 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0476599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2227  hypothetical protein  27.92 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0690  putative cellulose biosynthesis protein  27.92 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  26.88 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2141  hypothetical protein  27.92 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.5 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2012  putative cellulose biosynthesis protein  27.92 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6822  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.38 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.05 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  43.02 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011780  BbuZS7_F12  putative PF32  26.22 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.63 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.5 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.2 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.24 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  23.95 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  28.24 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  25.74 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.25 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  25.74 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2833  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.38 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0272925  n/a   
 
 
-
 
NC_002182  TCA06  virulence plasmid ParA family protein pGP5-D  24.31 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.35 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.17 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1469  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.76 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.88 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.1 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  26.1 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.2 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.33 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0184  hypothetical protein  40.22 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  52.08 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  27.31 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.08 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.03 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.98 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.17 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.02 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0359  sporulation initiation inhibitor protein soj  35.61 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00437391  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  40.7 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  51.06 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.5 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  54.17 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.06 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.08 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>