29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0608 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1184    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  60.29 
 
 
548 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  50.44 
 
 
578 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  48.5 
 
 
581 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  34.2 
 
 
575 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  34.14 
 
 
551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  36.29 
 
 
574 aa  253  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  35.08 
 
 
550 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  34.03 
 
 
579 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  33.69 
 
 
586 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  33 
 
 
559 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  33.09 
 
 
541 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  43.62 
 
 
552 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  45.09 
 
 
552 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  44.6 
 
 
573 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  33.95 
 
 
554 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  43.89 
 
 
559 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  42.56 
 
 
559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  29.67 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  33.26 
 
 
574 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  29.5 
 
 
568 aa  234  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  43.64 
 
 
530 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  45.19 
 
 
528 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  38.77 
 
 
512 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  41.83 
 
 
499 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  36.32 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  37.4 
 
 
331 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  28.1 
 
 
569 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.75 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>