31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0478 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  81.88 
 
 
574 aa  925    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1182    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  54.27 
 
 
573 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  53.75 
 
 
541 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  51.37 
 
 
550 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  50.72 
 
 
559 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  52.13 
 
 
551 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  51.96 
 
 
554 aa  515  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  51.36 
 
 
559 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  51.18 
 
 
530 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  51 
 
 
559 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  45.26 
 
 
575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  43.47 
 
 
586 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  45.28 
 
 
579 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  66.11 
 
 
552 aa  420  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  66.45 
 
 
552 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  40.77 
 
 
528 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  36.38 
 
 
499 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  36.99 
 
 
512 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  35.27 
 
 
548 aa  249  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  44.44 
 
 
578 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  32.02 
 
 
568 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  31.84 
 
 
568 aa  238  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  44 
 
 
581 aa  238  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  33.26 
 
 
574 aa  233  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  38.25 
 
 
510 aa  174  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  39.38 
 
 
331 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  33.13 
 
 
569 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.19 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  37.38 
 
 
361 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  37.38 
 
 
361 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>