30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2334 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  67.9 
 
 		 554 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1098    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  69.33 
 
 		 550 aa  711    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  66.55 
 
 		 559 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  65.73 
 
 		 530 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  77.76 
 
 		 559 aa  770    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  68.59 
 
 		 551 aa  704    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  66.61 
 
 		 573 aa  673    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  65.95 
 
 		 559 aa  689    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  94.71 
 
 		 552 aa  928    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  60 
 
 		 541 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  56.08 
 
 		 574 aa  578  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  54.59 
 
 		 574 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  47.5 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  46.84 
 
 		 575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  45.52 
 
 		 579 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  42.75 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  50.91 
 
 		 512 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  50.61 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  37.21 
 
 		 548 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  36.05 
 
 		 578 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  31.25 
 
 		 568 aa  252  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  35 
 
 		 574 aa  250  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  30.9 
 
 		 568 aa  248  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  44.41 
 
 		 581 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  37.13 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  34.35 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  31.22 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  41.38 
 
 		 2449 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>