20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0053 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  100 
 
 		 326 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  45.61 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  40.47 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  40.13 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  40.74 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  39.8 
 
 		 365 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  38.64 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  28.27 
 
 		 357 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  36.26 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  33.75 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  35.67 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  35.67 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  35.67 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  32.76 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  30.98 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  31.87 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  33.92 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  34.36 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  30.99 
 
 		 321 aa  52.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  27.84 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>