19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4547 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0096  plasmid partition protein ParB  93.13 
 
 
364 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4365  ParB family protein  98.08 
 
 
365 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0572236  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4452  ParB family protein  97.81 
 
 
365 aa  723    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0140271  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4547  ParB family protein  100 
 
 
365 aa  738    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08266  plasmid partition protein ParB  63.2 
 
 
356 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0053  plasmid Partition par B protein  40.13 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0155  virulence regulon transcriptional activator VirB  28.72 
 
 
309 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4225  hypothetical protein  27.78 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.699695  normal  0.542878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  33.52 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  31.55 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  29.89 
 
 
323 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  29.26 
 
 
324 aa  59.3  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  30.94 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  27.27 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  28.74 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  28.74 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  28.74 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  28.32 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  34.74 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>