285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3947 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  100 
 
 		 382 aa  764    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4251  plasmid-partitioning protein  29.88 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0980763 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0008  plasmid-partitioning protein  33.89 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.188709 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0046  plasmid-partitioning protein  30.38 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.047127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07050  hypothetical protein  34.97 
 
 		 324 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0021  plasmid-partitioning protein  30.38 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155316  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0006  plasmid-partitioning protein  31.17 
 
 		 323 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000994  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB  34.27 
 
 		 324 aa  86.3  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0072  plasmid-partitioning protein  30 
 
 		 323 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000633113 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0131  ParB family protein  34.97 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_41  putative plasmid partition protein B  29.28 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0344008  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  30.22 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  30.54 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  31.97 
 
 		 295 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41.18 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  28.38 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 306 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  26.74 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  30.86 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  26.53 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  28.37 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  28.37 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  32.19 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  29.3 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  29.94 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  28.49 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  32 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  29.25 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  29.94 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  36.61 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  31.85 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  34.92 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  31.33 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  33.87 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  29.17 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3268  ParB family protein  36.76 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  28.02 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  39.36 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  28.31 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  29.3 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  29.3 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  29.3 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  29.3 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  29.3 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  29.3 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  29.3 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  29.3 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5036  parB-like partition proteins  24.55 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  41.76 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  29.3 
 
 		 297 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  29.3 
 
 		 297 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  29.3 
 
 		 305 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  28.22 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  25.93 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  32.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  31.62 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  30 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  35.2 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  35.71 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  32.21 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  40.91 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  29.05 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  31.39 
 
 		 263 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  31.39 
 
 		 263 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  28.66 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  29.21 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  35.71 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  26.39 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  34.29 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  29.81 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  38.2 
 
 		 290 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  35.14 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  29.81 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  29.81 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  31.21 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  34.19 
 
 		 283 aa  53.9  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  27.27 
 
 		 334 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  38.2 
 
 		 290 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  34.69 
 
 		 297 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  27.06 
 
 		 337 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3590  parB-like partition protein  24.48 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  26.91 
 
 		 281 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  31.86 
 
 		 289 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  34.17 
 
 		 311 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  26.75 
 
 		 323 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  25.32 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  36.94 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  32.5 
 
 		 311 aa  53.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  27.42 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  25.75 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  35 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  27.57 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  28.57 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  25.97 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  29.37 
 
 		 290 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1123  parB-like partition protein  35.78 
 
 		 572 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  29.19 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>