72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5044 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  100 
 
 		 332 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  39.75 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  36.33 
 
 		 350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  32.04 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  30.36 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  31.29 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  26.1 
 
 		 353 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  26.1 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  26.1 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  26.1 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  26.1 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  27.74 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  29.66 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  27.76 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  27.76 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  27.76 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  27.76 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  27.76 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  27.76 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  27.76 
 
 		 355 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  26.88 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  25.74 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  27.05 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  28.24 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  26.1 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  28.24 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  26.91 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  25.74 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  28 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  27.06 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  27.06 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  27.45 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  27.06 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  23.46 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  25.88 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  25.88 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  26.55 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  26.55 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  25.44 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  25.25 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3947  parB-like partition protein  25.56 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00257685  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  29.19 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  25.66 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  24.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  24.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  24.65 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  23.65 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  24.83 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0077  ParB family protein  30.63 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478454  hitchhiker  0.00493853 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  25.45 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1104  putative plasmid partition protein  30.66 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  23.96 
 
 		 529 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  23.39 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0252  parB-like partition protein  22.27 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  22.45 
 
 		 282 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  25.87 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2024  parB-like partition protein  25.81 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000382297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  22.38 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  22.76 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  25.12 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  22.58 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5284  ParB-like partition protein  27.88 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.589865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  24.85 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  25.49 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  22.18 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  23.33 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  22.22 
 
 		 555 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3014  ParB family protein  37.36 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.584677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  27.97 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  23.45 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  25 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  28.57 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>