234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4247 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  100 
 
 		 324 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  58.64 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  61.87 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  33.11 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  30.36 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  31.23 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  31.23 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  31.23 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  31.23 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  31.23 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  31.23 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  31.23 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  30.86 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  35.69 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  32.59 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  29.94 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  30.29 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  29.09 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  30.97 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  29.47 
 
 		 353 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  30.13 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  30.13 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  29.78 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  29.78 
 
 		 343 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  29.89 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  29.78 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  30.24 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  30.77 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  30.24 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 353 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  29.97 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  30.21 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  27.66 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  29.36 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  29.72 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  29.72 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  26.79 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  28.99 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  29.22 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  29.86 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  25.83 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  24.82 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  28.86 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  24.82 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  28.72 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  32.21 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  32 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  25.18 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  25.95 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  32 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2003  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.63 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  26.38 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  29.81 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  28.05 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  21.11 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  27.15 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  31.25 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  30.2 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  27.36 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  25.3 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  28 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  27.08 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  28.77 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  26.9 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  24.83 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  24.71 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  29.68 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0509  parB-like partition protein  25.6 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  30.43 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  30.2 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  29.61 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  25.3 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  25.91 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  28.86 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  28.98 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  25.45 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  26.85 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  29.45 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  25.1 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  26.85 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  26.85 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  25.09 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  27.45 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  29.03 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  26.39 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  27.27 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  25.45 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  30.18 
 
 		 358 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  28.86 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  26.85 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  27.81 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  26.85 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  26.85 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  26.17 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  26.39 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  27.15 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  30.15 
 
 		 268 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>