215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5081 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  100 
 
 		 345 aa  701    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  42.51 
 
 		 358 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  42.51 
 
 		 358 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  39.34 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  39.63 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  43.27 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  39.09 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  38.67 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  38.67 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 343 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  29.76 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  29.84 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  34.03 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  34.03 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  30.74 
 
 		 355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  29.77 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  29.67 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  28.4 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  28.4 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  29.7 
 
 		 334 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  29.02 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  29.02 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  29.02 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  29.02 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  29.96 
 
 		 336 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  35.69 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  33.73 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  32.66 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  24.32 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  29.66 
 
 		 332 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  27.21 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  30.41 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  29 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  29.44 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  28.64 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  28.52 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  28.64 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  28.17 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  28.17 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  28.17 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  28.17 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  28.17 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  28.17 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  28.17 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.64 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  28.72 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  28.5 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  28.16 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  30.7 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  28.16 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  25.74 
 
 		 289 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  28.11 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  27.67 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  25.2 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  27.57 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  25.65 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  27.67 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  27.4 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0358  stage 0 sporulation protein J  24.62 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000194185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  27.67 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  27.89 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  26.42 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  26.26 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  29.27 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  27.56 
 
 		 529 aa  57  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  30.16 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  27.27 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  27 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  26.77 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  25.98 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  26.27 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  26.2 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  26.67 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  26.77 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  26.77 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  27.67 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  25 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  27.86 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4934  parB-like partition proteins  27.44 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190039  normal  0.260237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  27.18 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  26.15 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  26.61 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  23.91 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  25.57 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  25.71 
 
 		 472 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  23.83 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  27.83 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  24.19 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  26.29 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  24.19 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  26.29 
 
 		 256 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>