53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4934 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008759  Pnap_4934  parB-like partition proteins  100 
 
 		 331 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190039  normal  0.260237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  28.69 
 
 		 354 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  28.51 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  28.51 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  28.51 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  28.94 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  28.51 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  28.15 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  28.51 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  28.51 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  28.29 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  27.24 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  28.68 
 
 		 353 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  27.85 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  27.52 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  27.52 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  26.62 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  26.18 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  26.34 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  26.89 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  25 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  25.63 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  25.63 
 
 		 335 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  26.09 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0783  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000781994 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6603  parB-like partition proteins  27.49 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6444  ParB family protein  27.49 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  27.44 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4306  ParB family protein  25.69 
 
 		 355 aa  53.1  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  25.48 
 
 		 358 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0113  ParB family protein  40.68 
 
 		 376 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  25.48 
 
 		 358 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0037  transcription repressor protein KorB  26.82 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.871786  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  23.58 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  25.11 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  23.58 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  23.58 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  23.47 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  26.44 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  30.86 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  26.97 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  24.74 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  24.74 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  23.98 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  21.8 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  31.61 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  31.61 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  23.48 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  23.53 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>