More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5757 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  100 
 
 		 343 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  99.13 
 
 		 343 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  92.13 
 
 		 343 aa  630  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  89.77 
 
 		 341 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  90.09 
 
 		 343 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  89.8 
 
 		 343 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  89.8 
 
 		 343 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  53.87 
 
 		 358 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  53.87 
 
 		 358 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  39.22 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  32.55 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  29.67 
 
 		 355 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  34.27 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  30.56 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  30.56 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  30.56 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  30.56 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  30.56 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  29.47 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  30.56 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  32.06 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  32.81 
 
 		 353 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  29.28 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  32.42 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  32.42 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  32.03 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  32.03 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  28.74 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  27.33 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  26.99 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  29.78 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  30.5 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  25.77 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  28.46 
 
 		 321 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  27.24 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  29.76 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  25.6 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  29.88 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  28.76 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  30.46 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  29.28 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  27.18 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  30.81 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  31.94 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  28.31 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  29.29 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  29.29 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  32.48 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  28.12 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  30.1 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  28.09 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  29.41 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  29.19 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  28.44 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  27.62 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  29.8 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  35.38 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  31.9 
 
 		 268 aa  72  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  28.5 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  27.84 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  30.21 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  28.88 
 
 		 281 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  27.88 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  27.5 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  28.74 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  36.15 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  31.17 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  31.17 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  31.17 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  31.37 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  28.17 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  30.05 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  27.6 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  30.12 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  28.64 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  29.84 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  29.25 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  28.17 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  29.73 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  29.93 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  29.93 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  29.93 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  29.93 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  27.05 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  28.19 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  29.25 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  29.93 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  27.51 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  29.59 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  28.99 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  29.93 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  28.02 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  30.92 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  28.28 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  29.68 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>