More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6671 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  94.41 
 
 		 343 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  98.25 
 
 		 343 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  100 
 
 		 343 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  98.54 
 
 		 343 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  90 
 
 		 341 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  89.8 
 
 		 343 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  89.5 
 
 		 343 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  53.71 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  53.71 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  39.51 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  33.97 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  30.09 
 
 		 353 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  33.94 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  32.82 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  29.6 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  34.05 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  32.47 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  32.1 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  32.1 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  31.73 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  31.73 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  27.16 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  27.61 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  28.97 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  28.97 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  30.77 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  30.98 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  28.91 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  25.96 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  25.4 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  30.41 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  30.15 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  30.15 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  30.15 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  29.8 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  30.15 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  26.44 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  26.67 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  30 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  29 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  29.06 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  28.21 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0681  spoOJ protein  30.89 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  28.92 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  35.38 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  29.27 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  31.51 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  29.5 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  30.1 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  28.79 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  28.5 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  27.91 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  36.15 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  28.44 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  29.23 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  29.65 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  27.94 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  31.88 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  32.7 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  29.36 
 
 		 529 aa  70.1  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  30.52 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  26.07 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  27.94 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  27.93 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  30.52 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  31.01 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  30.26 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  29.65 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  26.81 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  28.64 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  29.33 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  27.2 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1542  parB-like partition protein  32.14 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000160995  unclonable  1.80022e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  29.25 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  29.25 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  29.25 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  28 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  29.25 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  30.58 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  26.34 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  29.39 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  29.35 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  27.54 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  28.28 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  28.69 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  28.69 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  30.6 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1732  stage 0 sporulation protein J  28.5 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  28.31 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>