More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3290 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  100 
 
 
355 aa  727    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  99.72 
 
 
355 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  99.72 
 
 
355 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  99.72 
 
 
355 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  95.21 
 
 
355 aa  698    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  99.72 
 
 
355 aa  723    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  99.72 
 
 
355 aa  723    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  99.72 
 
 
355 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  83.66 
 
 
353 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  83.06 
 
 
353 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  82.78 
 
 
353 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  82.77 
 
 
353 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  82.77 
 
 
353 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  81.94 
 
 
353 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  82.22 
 
 
353 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  81.51 
 
 
352 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  80.68 
 
 
352 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  81.92 
 
 
354 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  32.82 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  32.82 
 
 
343 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  32.08 
 
 
343 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  32.82 
 
 
343 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  32.44 
 
 
341 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  32.06 
 
 
343 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  32.06 
 
 
343 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  31.46 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  30.74 
 
 
345 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  31.95 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  31.09 
 
 
335 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  31.09 
 
 
335 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  29.76 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  27.07 
 
 
358 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  27.07 
 
 
358 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  31.23 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  29.18 
 
 
321 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  28.41 
 
 
290 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  22.68 
 
 
334 aa  93.2  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  27.4 
 
 
332 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4934  parB-like partition proteins  28.15 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.190039  normal  0.260237 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  26.13 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  29.41 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  27.49 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  26.61 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  26.25 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  28.99 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  27.91 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  25.85 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  28.44 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  27.52 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  25.71 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  25.71 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  25.38 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  34.67 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  30.68 
 
 
314 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  27.23 
 
 
298 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  27.27 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  24.23 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  28.24 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  27.69 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  24.44 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  24.67 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  24.53 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  27.78 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7548  parB-like partition protein  27.68 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  25.6 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  24.23 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  26.75 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  25.68 
 
 
294 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  27.43 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  29.68 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  29.89 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  30.14 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  26.75 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  31.61 
 
 
362 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  29.58 
 
 
283 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  26.27 
 
 
303 aa  63.9  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6109  parB-like partition protein  32.43 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  29.8 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  25.89 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  29.09 
 
 
324 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  22.92 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  29.76 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  28.4 
 
 
290 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  26.1 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  28.04 
 
 
272 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  25.59 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  28.98 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  26.71 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  26.32 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1409  ParB-like partition protein  23.47 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2422  parB-like partition protein  28.3 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568139 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  26.6 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  28 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>